تم تصميم المنهج لتخريج كادر طبي متمكن يوفي المستوي العلمي ويبرز الكفاءة المطلوبة مع الخصوصية اللازمة لتحقيق أهداف الجامعة وقد روعي فيه :

خصوصية الجامعة من حيث إفريقية البيئة ، متنوعة الثقافة .

اختلاف جنسيات الطلاب وبالتالي اختلاف لغاتهم وثقافاتهم على أن تكون اللغتين العربية ثم الإنجليزية هما لغتا التدريس بالكلية .

هدف الجامعة المتمثل في تخريج كادر يملك المقدرات والمهارات التي تؤهله لأداء دور تأصيلي في مجتمعه من خلال التنسيق مع البرامج الدعوية التي تقوم بها الكليات الأخرى بالجامعة من العمل الريفي والميداني داخل المجتمعات المختلفة .

أن تنتهج الكلية أسلوب الانفتاح والتعاون وفتح قنوات الاتصال محلياً وإقليميا وعالمياً والاشتراك في الجمعيات والروابط العلمية لتطوير برامجها وتحديثها بالتعاون مع الكليات المماثلة .

التوافق مع محدودية الإمكانات المتوفرة والتي يجب أن تستغل بصورة جيدة ومرشدة على أن تساهم كل الأطراف بما في ذلك الجامعة والطالب والمجتمع .  

الــنــظــام الـــدراســي ومــــدة الــــدراســــة :

 مدة الدراسة، أربعة سنوات مقسمة على ثمانية فصول دراسية و مدة الفصل الدراسي 15 أسبوعاً تتبع الكلية النظام الفصلي، و يدرس كل مقرر خلال فصل دراسي واحد و تكون الامتحانات للمقررات بنهاية الفصل الدراسي الذي تدرس فيه وتكون نهاية العام الدراسي في نهاية الفصل الدراسي الثاني ، السنة الرابعة سنة التخصص في فرع واحد من فروع المختبرات الطبية.

الـــتــوزيـــع الـــزمـــني للــســـنة الــــدراســـية :

تتكون السنة الدراسية من 30 أسبوعا ويشمل فصلين حيث يستغرق الفصل الدراسي 15 أسبوعا.

لــــغــــة التدريس :

اللغتين العربية و الإنجليزية هما لغتا التدريس بالكلية.

وســـائــــل الـــتعــلـــيــم والــــتــعــلــم :

تقوم الكلية بالاتي :

 التدريس بوسائله المختلفة في مجالات التخصص وفقاً للمقررات الدراسية واعتماد العملية التعليمية على مختلف وسائل التعليم والتعلم وتشمل الآتي :

طرق التدريس :

المحاضرات.

العملي.

حلقات النقاش Group Discussion.

حل المشكلات pbl.

1-17-1-2 المعينات و الوسائل السمعية و البصرية :

الحاسوب و الشبكة الدولية (الانترنت) .

عارض الشرائح (slide projector ) .

العارض الرأسي (over-head projector).

الوسائط المتعددة (multimedia).

التدريب الميداني.

 مشروع بحث التخرج في احد مجالات علوم المختبرات الطبية.

 البحوث والدراسات المتعلقة بعلوم المختبرات الطبية.

 الندوات و المؤتمرات العلمية لبحث المسائل المتعلقة بالتخصصات المختلفة بالكلية.

 الاهتمام بالإصدارات العلمية والمجلات المتخصصة في مجال عمل الكلية.

 التعليم الذاتي و السمنارات و الواجبات المحددة.